1、肾脏损害。齐齐哈尔中都男科医院医生指出，尿道结石与梗阻和感染三者互为因果，促使病变发展。结石引起梗阻，梗阻诱发感染，感染又促成结石，加重梗阻，终破坏肾组织，损害肾功能。
2、直接损伤。可引起黏膜上皮细胞脱落，溃疡形成，多核WBC和圆细胞侵润以及间质纤维化；输尿管的管腔较小，结石刺激引起输尿管痉挛，如结石表面粗糙和有尖锐棱角，将造成黏膜较重损伤，导致局部水肿，充血，上皮脱落，糜烂或坏死，黏膜溃蚀时损及小 血管，可引起不同程度的血尿；如结石嵌顿于输尿管腔，除梗阻外，可能引起输尿管炎，输尿管周围炎，管壁增厚，肉芽肿性狭窄，刺激、局部坏死→穿孔，尿外渗。长期刺激，还可引发肿瘤。
3、尿道梗阻。多数尿道结石患者会造成尿流梗阻导致肾积水及输尿管扩张，损害肾组织及其功能。膀胱和尿道结石可引起排尿困难或尿潴留，久而久之也可引起双侧输尿管扩张、肾脏积水，损害肾功能。
4、尿道感染。尿道结石对尿路上皮的直接损害多伴有感染，特别是引起尿路梗阻时，感染则更易发生，感染严重者可导致肾盂肾炎、肾积脓。
5、局部损伤。尿结石可以导致肾盂，肾炎，肾盏上皮纤维化，长期受刺激可引起磷状上皮癌。
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