非淋菌性尿道炎与男性不育。前列腺分泌的液体是组成精液的主要内容。尿道起自膀胱，向下而行，上面有精囊管开口，再下面有许多前列腺开口，然后就进入阴茎，最后开口于龟头。性生活高潮射精时，精囊和前列腺都会收缩，这样就会把储存在精囊里面的精子和前列腺液一起排出，这就是射精时排出的精液。
尿道是排尿和射精的共用通道，如果尿道发生感染，除了引起泌尿系统症状外，对生殖功能也会产生影响。非淋菌性尿道炎(NGU)是男性常见的尿道感染性疾病,主要的传播途径是经过性生活，所以也属于性传播疾病。其主要致病的病原体有细菌、衣原体、支原体、滴虫和单纯疱疹病毒等。非淋菌性尿道炎的典型的症状是尿道分泌物增多、尿痛、尿道发痒。一般潜伏期为1-5周，性接触后2-3周是发病高峰。尿痛轻重不等，尿道分泌物有时量很少，呈粘液状，多于清晨出现，有时于尿道口形成结痂；有时分泌物量很多，呈脓性；也有的病人毫无症状。
在不育夫妇中，特别是那些所谓不明原因的不育夫妇中，男性精液中衣原体和支原体等病原体存在的比例远远高于正常人，因此可以认为这些病原体是导致不育的因素之一。非淋菌性尿道炎一般通过下面这些途径影响男性的生育能力： 因尿道炎导致尿道狭窄和射精功能障碍。尿道感染可以直接影响尿道的上皮，在感染的局部形成疤痕。这种情况严重时可造成尿道狭窄，造成排尿困难，同时也可以造成射精的障碍。
尿道邻近器官的感染。附睾是运输精子的管道，如果发生附睾炎，可造成梗阻，使得精子不能运送出睾丸。前列腺液是组成精液的主要成分，如果发生前列腺炎，精液里面就可能有大量白细胞。在精液常规检查中，如果精液中每高倍显微镜视野下白细胞个数超过5个，就是不正常，将导致不育。
诱发产生抗精子抗体。衣原体和支原体等可诱导人体产生抗体，而这些抗体与精子有交叉，因此可能会诱导人自身产生抗精子抗体，从而造成不育。 对精子的直接作用。支原体是一种很微小的生物，可以吸附在精子中部，影响精子的活力。曾经有人对支原体阳性的男性采用针对性治疗后发现，精子的各项指标均有明显提高，妊娠率也有提高。
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