本病是因生殖结节发育不全所致。此种病人除无阴茎外，还可能合并其他泌尿生殖器、直肠与肛门、心血管系统以及下肢畸形。因此，病人常常是短命的。对于能够成活下来的病人来说，最好的治疗方法是转归为女性，其手术包括睾丸切除及外阴成形等。
二、隐匿阴茎畸形
本病多见于肥胖体型的人（阴囊肿大造成者除外）。病人常因肥胖导致阴茎发育异常，出现包茎及阴茎发育短小等症，除影响排尿外，对性生活影响也较大。其治疗方法是进行综合性减肥治疗，必要时可实施阴茎成形术并辅以内分泌治疗。儿童患者应尽量在青春期前完成手术。
三、双阴茎畸形
本症是因胚胎期阴茎始基发育障碍所引起的，常合并其他畸形，如双膀胱、双直肠以及肛门、脊柱等部位的畸形。因此，对双阴茎畸形要做全面的体格检查，以得出全面的诊断。治疗单纯性双阴茎畸形比较简单，可保留较粗壮的一侧而将另一侧切除。
四、小阴茎畸形
治疗此类病人可依下列原则进行：1、首先解除病人的排尿困难，应尽早实施尿道整形术。2、进行内分泌治疗，雄性激素开始使用的时间越早，其治疗效果越好。3、在必要的情况下，可进行小阴茎增大整形术或改变性别的手术。
五、大阴茎畸形
大阴茎畸形者的阴茎长度和直径均较正常者大，国内曾报道有阴茎长度达18 cm，根部直径达3.5 cm，阴茎头长3.5 cm，头部直径达5.5 cm者。大阴茎畸形病人还常常合并内分泌系统的其他疾病。治疗这种病人一般是采用部分切除阴茎海绵体的缩小手术。
六、阴囊的先天畸形
阴囊的先天畸形比较少见，其发病原因尚不十分清楚。它常与其他生殖器畸形同时存在。根据文献报道，阴囊部的畸形主要有先天性无阴囊、阴囊发育不全、阴囊异位以及阴囊裂等数种。其治疗方法为视情况选择不同的整形手术。
七、阴茎的弯曲畸形
本病病人的主要症状是阴茎弯曲，同时伴有排尿及性生活障碍。其治疗方法主要是实施包括切除影响阴茎伸直组织在内的阴茎整形术。
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